Setelah itu, karir animasinya melesat sehingga ia menjadi seorang legenda pembuat kartun populer.
Pada tahun 1964, dia membuat karya animasi Here Nudnik dan How to Avoid Friendship, yang membuatnya masuk nominasi Academy Award.
Selama karirnya, Gene Deitch pernah bekerja sebagai direktur kreatif di Terrytoons, (perusahaan di bawah 20th Century Fox) di mana ia menciptakan karakter seperti Sidney the Elephant, Gaston Le Crayon, Clint Clobber and Terr’ble Thompson.

Utas dari @DownInkwell juga mengenang film kartun legendaris di tahun 1966 berjudul Alice of Wonderland in Paris yang disutradarai oleh Gene Deitch.
Di sekitar tahun 1960-an, Gene Deitch menjadi pimpinan Rembrandt Films di mana ia menyutradarai film kartun Popeye dan Tom and Jerry untuk studio Metro-Goldwyn-Mayer (MGM).
Seri animasi Tom and Jerry mengantarkan Gene Deitch meraih Piala Oscar. Kabar mengenai Gene Deitch meninggal tentunya membuat pecinta film animasi seperti Tom and Jerry juga ikut berduka cita.