Ada sebuah tombol geser yang bisa digunakan untuk tiga keperluan, yaitu "ON", "SBY" (untuk mode siaga) dan "ALT" (untuk ketinggian pesawat). Kokpit juga bisa dipasangi pemutus sirkuit untuk transponder.
Pada penerbangan normal, ada beberapa alasan yang membuat pilot mematikan transponder. Satu, adalah ketika pesawat terbang terlalu dekat dengan pesawat lainnya. Pusat kendali lalu lintas udara biasanya meminta pilot untuk mematikan transponder atau menggesernya ke posisi standby. Kedua, pilot akan mematikan transponder jika alat tersebut mengirim informasi yang salah. Pesawat masih bisa dipantau sampai keluar dari zona pantauan radar. (The Strait Times)