Saat ini Toyota Kijang Innova ditawarkan dalam dua pilihan mesin, yakni bensin 2.0L dan diesel 2.4L.
Tipe bensin menggunakan seri 1TR-FE, 4 silinder, in-line, 16 valve DOHC dengan Dual VVT-i yang memproduksi tenaga 137 Tk pada 5.600 rpm dan torsi 183.3 Nm pada 4.000 rpm. Pada varian Diesel, membenamkan 2GD FTV, 4 silinder, in-line, 16 valve, DOHC dengan VNT Intercooler. Mesin ini punya output 146 dk pada 3.400 rpm.