Selain sarana transportasi darat berupa bus, dalam PON dan Peparnas Kementerian Perhubungan juga memberikan dukungan lainnya, seperti:
- Pembangunan dermaga dan 2 unit bus air yang akan dioperasikan di Danau Sentani
- Pengadaan dan pemasangan perlengkapan jalan
- Pembangunan Terminal Tipe A Entrop Kota Jayapura
- Pembangunan Area Traffic Control System (ATCS) di Kota Jayapura.