Hingga akhirnya pada awal 2000, politikus yang pernah mengenyam pendidikan di SMAN 53 Jakarta itu masuk ke PAN. Di Partai ini kariernya terus melejit. Pada 2004 dia terpilih menjadi anggota DPR RI periode 2004-2009.
Tahun 2005, Zulkifli Hasan diangkat menjadi Sekjen DPP PAN. Kemudian pada 2009, dia diangkat menjadi Menteri Kehutanan dalam Kabinet Indonesia Bersatu II hingga 2014.
Karier politik Zulkifli Hasan setelah itu terus menanjak. Dia terpilih menjadi Ketua Umum PAN pada 2015. Kemudian menjabat Wakil Ketua MPR RI periode 2019-2022.
Pada 2022, Zulkifli Hasan diangkat menjadi Mendag hingga berakhirnya masa jabatan pemerintahan Joko Widodo-Ma'ruf Amin di 2024.