Pada November 2020, Habib Luthfi bin Yahya mendapat gelar Doktor Honoris Causa Bidang Komunikasi Dakwah dan Sejarah Kebangsaan dari Universitas Negeri Semarang.
Habib Luthfi juga punya jabatan mumpuni di sejumlah organisasi di antaranya sebagai Ra’is ‘Am jam’iyah Ahlu Thariqah al Mu’tabarah an Nahdiyah, Ketua Umum MUI Jawa Tengah, Ketua Forum Sufi Internasional dan anggota Dewan Pertimbangan Presiden Periode 2019-2024 serta Pendiri dan Pembina Majelis Ta'lim Kanzus Sholawat Pekalongan-Jawa Tengah.