PKB tak jadi memberikan tiket kepada Mahfud di Pilpres 2014. PKB pada akhirnya mendukung duet Jokowi-Jusuf Kalla, padahal saat itu PKB mengajukan nama Mahfud MD.
Hingga akhirnya pada 2024 ini, Mahfud MD menjadi Cawapres dari Ganjar Pranowo. Namun, Presiden Jokowi tidak berpiihak kepada pasangan Ganjar-Mahfud.