Berbagai spekulasi mengenai motifnya muncul. Sebagian kalangan menariknya ke arah politik.
Terlepas dari spekulasi yang muncul, pemerintah yang diwakili Menteri Koordinator Politik, Hukum, dan Keamanan Mahfud MD meminta aparat penegak hukum mengadili pelaku secara fair dan proses hukumnya secara terbuka.
Mahfud juga menginstruksikan supaya semua aparat menjamin keamanan para tokoh agama yang sedang berdakwah.