Namun, karena mengungkap berbagai kasus kejahatan publik yang disembunyikan, publikasi ini rentan digunakan untuk kepentingan kelompok atau pihak tertentu.
“Pada satu sisi, IndonesiaLeaks ingin agar masyarakat tahu bahwa terdapat indikasi persoalan serius yang melibatkan pejabat publik. Pada lain sisi, data dan informasi yang dipublikasikan jurnalis, bisa jadi dimanfaatkan untuk menyerang pemerintah,” tandasnya.