Inovasi Muhammadiyah semakin luas karena aktif melakukan pemberdayaan sosial-ekonomi di seluruh Indonesia. Sasarannya untuk komunitas masyarakat urban, pedesaan, pedalaman, terpencil, kawasan kepulauan, masyarakat adat, di area rawan bencana.
Muhammadiyah boleh dibilang sebagai organisasi Islam pribumi pertama yang mereformasi sistem pendidikan Islam modern. Tata kelola manajemen berlandaskan prinsip akuntabilitas dan berorientasi pada dampak, serta mempelopori gerakan emansipasi perempuan muslim.
Paham dan ideologi keagamaan yang dipegang oleh Muhammadiyah adalah dakwah, tajdid, dan Islam Berkemajuan yang berpandangan wasathiyah.
Dakwah adalah untuk mensyiarkan wajah Islam yang menebar manfaat dan berkeunggulan. Tajdid sebagai watak adaptif pemikiran keislaman yang senantiasa selaras dengan perkembangan ilmu pengetahuan dan teknologi.
Terakhir, Islam berkemajuan merupakan karakter wawasan serta praktik beragama ala Muhammadiyah.