Bagja melanjutkan pendidikan tingginya di Universitas Indonesia (UI) Fakultas Hukum angkatan 1998 dan berhasil lulus pada tahun 2003.
Selama menjadi mahasiswa, Bagja aktif menjabat di berbagai organisasi kemahasiswaan, seperti Ketua Umum Senat Mahasiswa FH UI periode 2001-2002, Ketua Umum Komisariat HMI FHUI periode 2000-2001, dan Wakil Sekretaris Umum PTKP HMI Cabang Depok periode 2001-2003.
Setelah lulus dari UI, Bagja bekerja sebagai menjadi Peneliti Muda di Pusat Konstitusi Studi Hukum FH UI dibawah supervisi Prof. Dr. Jimly Ashshiddiqie.
Pada 2008, Bagja melanjutkan pendidikan magister hukumnya di Utrecht University Belanda dan sempat menjabat sebagai Ketua Umum PPI (Perhimpunan Pelajar Indonesia) Utrecht.
Sekembalinya ke Indonesia pada tahun 2009, Bagja mengabdi sebagai dosen tetap di Fakultas Hukum Universitas Al Azhar Indonesia dan Tenaga Ahli MKD DPR RI.
Bagja sempat menempuh pendidikan doktoralnya di UI, namun ia memutuskan untuk berhenti dan memilih mengambil program doktoral di Universitas Andalas Padang pada tahun 2020 dan masih dalam proses menyelesaikan disertasi hingga saat ini.
Ia akhirnya bergabung dengan Bawaslu di tahun 2017 dan terpilih sebagai Ketua Bawaslu RI periode 2022 - 2027 melalui rapat pleno pimpinan di Gedung Bawaslu RI pada Selasa (14/02/2022) silam.
Kontributor : Dea Nabila
Baca Juga: PDIP Keluarkan Surat Pernyataan Penolakan yang Ditujukan ke KPU, Berikut Isinya