Karier Teddy semakin bersinar ketika ia ditunjuk sebagai ajudan Menteri Pertahanan Prabowo Subianto pada tahun 2020.
Sebagai ajudan, Teddy mendampingi Prabowo Subianto alam berbagai kegiatan resmi, baik di dalam maupun luar negeri.
Setelah Prabowo Subianto terpilih sebagai Presiden Republik Indonesia, Teddy Indra Wijaya diangkat sebagai Sekretaris Kabinet pada 21 Oktober 2024.
Sebagai Sekretaris Kabinet, Teddy bertanggung jawab untuk mendukung pelaksanaan pemerintahan, termasuk memberikan rekomendasi kebijakan, mengelola administrasi kabinet, dan memastikan kelancaran sidang kabinet.