Keanggotaan Kirgistan di AFC (Asian Football Confederation) baru dimulai pada tahun 1994, dan mereka membutuhkan waktu beberapa tahun untuk benar-benar mencuri perhatian dalam kompetisi sepak bola regional.
Puncak pencapaian mereka dalam hal kompetisi internasional adalah pada tahun 2019 ketika mereka berhasil lolos ke putaran final Piala Asia di Uni Emirat Arab. Meskipun mereka terhenti di babak 16 besar, pencapaian ini tetap menjadi tanda keberhasilan besar bagi Timnas Kirgistan.
Di luar Piala Asia, Kirgistan memiliki sejumlah prestasi yang patut diperhitungkan. Salah satunya adalah peringkat ketiga yang mereka raih di AFC Challenge Cup pada tahun 2006.
Selain itu, mereka juga mencatatkan prestasi yang mengesankan dengan menduduki peringkat keempat pada keikutsertaan perdana mereka dalam ajang CAFA Nations Cup 2023, menunjukkan perkembangan pesat dalam sepak bola regional.
Kualifikasi untuk Piala Asia 2023 juga menjadi tonggak bersejarah bagi Timnas Kirgistan. Seperti halnya Timnas Indonesia, mereka berhasil lolos ke putaran final melalui jalur runner-up terbaik selama Kualifikasi Piala Asia 2023.
Saat ini, Timnas Kirgistan dipimpin oleh pelatih berpengalaman asal Slovakia, Stefan Tarkovic. Pengalamannya sebagai mantan pelatih Timnas Slovakia memberikan wawasan berharga dalam upaya mengembangkan sepak bola Kirgistan.