Setelah meninggalkan Black Steel Manokwari, Eko dengan mengejutkan bergabung ke klub asal Kebumen, SKN FC pada 2019.
Hengkang dari SKN FC, Samuel Eko Putra kemudian pindah ke tim Bintang Timur Surabaya. Di sini dia meraih kesuksesan di level klub.
Eko berkontribusi mengantarkan Bintang Timur Surabaya menjadi kampiun Pro Futsal League 2021 dan juara AFF Futsal Cup 2022.
Di level timnas, Samuel Eko pernah membela Timnas indonesia di Piala Asia Futsal U-20 2017 yang melaju hingga babak perempat final sebelum dikalahkan Thailand.
Namanya juga sempat jadi perbincangan hangat setelah tampil impresif mewakili Kalimantan Barat di ajang PON XX Papua 2021.
[Aditia Rizki]