Alaba telah membela Bayern Munchen sejak 2009. Sebelum menjadi andalan Die Roten di sisi kiri pertahanan, atlet bertinggi badan 1,8 meter itu sempat dipinjamkan ke Hoffenheim selama setengah musim pada 2011.
Selama kariernya di tim inti Bayern Munich, Alaba telah memainkan 394 laga, mencetak 31 gol dan memberikan 49 assist bagi tim raksasa Jerman tersebut.