Fabregas lahir dari pasangan pengusaha. Ayahnya Francesc Fabregas Sr. adalah pengusaha properti, sementara sang ibu Nuria Soler menekuni usaha kue. Bakat pemain yang membawa Spanyol menjuarai Piala Dunia 2010 ini sudah terlihat sejak kecil, saat dirinya masih bermain untuk CE Mataro. Potensinya yang menonjol sampai membuat pelatih pertamanya takut kehilangan. Si pelatih, Senor Blai, bahkan tak pernah memainkan Fabregas di laga kontra tim muda Barcelona karena takut pemainnya itu diambil pencari bakat Barca.
Namun bakat Fabregas tetap saja tercium. Ia pun akhirnya masuk ke La Masia, akademi muda Barcelona. Fabregas kecil amat mengidolakan Barca dan Pep Guardiola, pemain bintang Barca yang kelak menjadi pelatihnya. Ada satu kenangan manis yang mungkin bakal tak terlupakan buat Fabregas. Sang idola, Guardiola, menghadiahkan jersey bernomor punggung 4 miliknya kepada Fabregas, sebagai penghiburan, kala kedua orang tuanya bercerai, 14 tahun silam.
"Untuk Francesc Fabregas, menunggu beberapa tahun untuk melihatmu mengenakan No 4 di Camp Nou. Semoga sehat. Semoga beruntung. Pep Guardiola".